Durante el Crucero 16 CIMAR Fiordos realizado entre el Estrecho de Magallanes y el Canal Beagle (53º11,16'S; 73º24,06'W-55º09'03,92''S, 68º08'27,9''W) se realizó un muestreo intermareal y submareal de 14 estaciones. Estas muestras se obtuvieron manualmente y por buceo apnea, en transectas perpendiculares a la línea de la costa, con orientación sur-este y en ellas se aplicó la metodología establecida en el Crucero CIMAR 15 para la caracterización de los biotopos costeros.Se determinaron 10 biotopos marinos que corresponden a tres grandes grupos:1) biotopos con fuerte influencia de agua dulce de deshielos y lluvias, con playas extensas sin pendientes rocosas; son de diversidad baja, con presencia notoria de Porphyra spp. en sectores rocosos planos y con salinidades que varían entre 1 y 20‰;2) biotopos rocosos con mayor pendiente, comparativamente con mayor influencia de mareas y presencia de algas rodófi tas, feófitas y clorófi tas asociadas a bivalvos, gasterópodos, cirripedios y otros invertebrados, y con salinidad de 24 a 28‰; y3) submareales someros, desde 1 hasta 16,4 m de profundidad, caracterizados principalmente por la presencia de feóficeas, Macrocystis pyrifera principalmente, asociadas con moluscos, crustáceos, poliquetos y equinodermos, y con salinidades entre 32 y 35‰.Se observaron coincidencias con los biotopos descritos para el sector del Parque Nacional Laguna San Rafael, estero Elefantes, archipiélago de los Chonos, y tres biotopos mencionados para los canales Trinidad y Smyth, al norte del Estrecho de Magallanes.Palabras claves: algas, biotopos marinos costeros, ecología litoral, Pacífico Sudeste, Chile